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課程內容雖然廣泛, 但部分內容並未能與實驗連貫. 即為: 第二週的實驗課有實驗站解說員面對完全沒有背景知識的學生之狀況發生, 顯現排課上出現疏失. 另外, 實驗站解說員亦不了解學生之背景知識, 經常重複課堂內容, 顯現實驗站與講師缺乏協調之事實.

沒有妥善的組織與規劃
原定二十個小時數的實驗課程只有實際不到四個小時數的操作, 大大不符合預期, 此狀況再度顯現與實驗站缺乏協調之窘境. 亦有少部分課程內容重覆, 或許講師之間亦未事先溝通協調.

值得思考的獎學金分級制度
簡章中明文獎學金被劃分為四千元、三千元、兩千元三個級別. 猜想研究中心提供獎學金的美意是鼓勵學生參加課程、引起學生興趣、提早培育研究人才. 並預設獎學金分級能引起學生之間的良性競爭. 此一做法略為瑕疵: 依照結業成績的優劣評定獎金即意味著忽略了學生的科系、年級、動機與研究背景. 伴有作業解答外流與公布更動不大的歷年考古題之情況, 此更說明將獎學金分級是不妥的做法.